Таможенная экспертиза может проводиться несколькими экспертами одной (комиссионная таможенная экспертиза) или разных экспертных специальностей (комплексная таможенная экспертиза).
Производство таможенной экспертизы комиссией экспертов определяется органом, назначившим таможенную экспертизу.
Комиссия экспертов, которой поручено производство таможенной экспертизы, согласует цели, последовательность и объем, предстоящих исследований, исходя из необходимости решения, поставленных перед ней вопросов.
В составе комиссии экспертов, которой поручено производство таможенной экспертизы, каждый эксперт независимо и самостоятельно проводит исследования, оценивает полученные им лично и другими членами комиссии результаты и формирует выводы по поставленным вопросам в пределах своих специальных знаний в области науки, техники, искусства или ремесла.
Не допускается проведение исследований полностью или частично лицами, не включенными в состав комиссии экспертов.
При проведении комиссионной таможенной экспертизы каждый из экспертов проводит исследования в полном объеме, и они совместно анализируют полученные результаты.
По итогам проведенных исследований эксперты составляют и подписывают совместное заключение.
В случае возникновения разногласий между экспертами каждый из них дает отдельное заключение по всем или некоторым вопросам, вызвавшим разногласия.
Комплексная таможенная экспертиза назначается в случаях, когда установление обстоятельств, имеющих значение для таможенного дела, возможно лишь путем проведения нескольких исследований с использованием разных отраслей знаний.
При проведении комплексной таможенной экспертизы каждый из экспертов проводит исследования в пределах своей компетенции. В заключении комплексной таможенной экспертизы указывается, какие исследования и в каком объеме провел каждый из экспертов, какие факты он лично установил и к каким выводам пришел. Каждый из экспертов подписывает ту часть заключения комплексной таможенной экспертизы, в которой содержатся эти исследования, и несет за них ответственность.
Общий вывод (выводы) делают эксперты, компетентные в оценке полученных результатов и формулировании этого вывода (выводов). Если основанием окончательного вывода комиссии экспертов или его части являются факты, установленные одним из экспертов (отдельными экспертами), то об этом должно быть указано в заключении комплексной таможенной экспертизы.
В случае возникновения разногласий между экспертами каждый из них дает отдельное заключение комплексной таможенной экспертизы по всем или отдельным вопросам, вызвавшим разногласия.